Was ich in solchen Fälle machen:
Die Charaktere der Gruppe können durchaus auch unterschiedliche Reputationen haben. Sprich, wenn ein Charakter durch seine extreme Professionalität, Trittsicherheit in der Welt und überragende Fähigkeiten auffällt (und das tut der Charakter eines Powergamers), dann wird er den entsprechenden Ruf weg haben.
Soezialisierte Vertreter einer Kunst (z.B. eines besonderen Kampfstils) werde sich nicht mehr als Lehrer zur Verfügung stellen, da sie ihre Kunst von ihm missverstanden fühlen, er wird verstärkt auf brandgefährliche Alleingänge geschickt, vielleicht fürchtet ein Vorgesetzter um seinen sicheren Sitz und wird den SC absichtlich in Gefahr bringen, usw.
Ähnlich kompetente und ehrgeizige Nichtspieler-Charaktere werden auf den Charakter aufmerksam werden (mit entsprechenden Folgen. In der Shadowrun-Welt wären das z.B. Entführungen durch Mega-Cons oder Söldnereinheiten, Gangkriege mit hochkarätigeren Mafiabossen, irgendein angepisster High Level Runner, der dem Charakter das Leben schwer macht). Im Extremfall, sprich, wenn der Spieler nicht einen Gang runter fährt und den Charakter etwas mehr "low profile" spielt, führt das zum Tod des Charakters.
Dann hat sich das Powergaming-Problem ohnehin gelöst, denn bis der Charakter wieder auf dem Level der anderen SCs ist, wird auch mit power-gaming Zeit vergehen.
Natürlich läuft das wieder auf dieses Spielleiter vs. Spieler raus, das ich sehr hasse. Aber manche Spieler verstehen es nach einem "Knall vor den Bug". Wenn das nichts hilft bin zumindest ich inzwischen auf dem Punkt, dass ich den Spieler dann rausschmeisse.
Wie Björn schon sagt, es herrscht immer Spielleitermangel, im Umkehrschluss immer Spielerüberschuss, man kann sich sowas also leisten.